杨徐邱后来说，他的有罪供述，都是根据办案人员的问话，被迫编造出来的，“我说杀人用的时间是10分钟，公安说时间不够，我就改口说是半个小时”。
杨徐邱称，他刚被抓走时，在派出所，办案人员还把从他家找到的一把杀猪刀丢在他旁边，问他是不是用这把刀杀的人，他被迫承认了。在派出所住了两个晚上后，他被送进了永平县看守所。在看守所，办案人员又让他改口承认是用匕首作的案。
曾担任杨徐邱辩护人的律师范晓媛称，案卷材料显示，杨徐邱对作案凶器的供述并不一致，其最早供述是“自家打制的杀猪刀”，后又说是“铜壳的匕首”，及“钢板锄”或“铁板锄”。
杨徐邱称，阿稳遇害的当晚，他在家忙着修拖拉机，一直没有出门，其妻子、儿子和女儿也均在家。当晚，还有一个叫赵王义的篾匠在他家留宿过夜。“赵王义可以证明我在家未出门，不存在作案时间。”
不过，《中国新闻周刊》注意到，1993年7月5日，赵王义在询问笔录中陈述：“杨徐邱吃完晚饭后，曾出去了一个来小时。”
因赵王义早在2012年10月就去世，相关情形已无法向当事人求证核实。
大理州人民检察院。摄影/本刊记者 周群峰
从“罪犯”变回“被告人”
1994年，大理州中院开庭审理此案，该院认为，杨徐邱杀死李某某，卷内有报案记录、匿名信、现场勘查笔录、尸体检验笔录等证据证实，被告人归案后所供述的犯罪事实、情节等与在案的其他证据相吻合。
法院还认为，1986年杨徐邱强奸金某某，卷内有被害人金某某的陈述、提取物证等笔录、辨认笔录、证人证言、刑事科学技术鉴定及活体体检照片等证据证实，被告人杨徐邱供述强奸金某某的犯罪事实、情节等与在案证据相互印证。
同年4月28日，大理州中院作出原一审判决：被告人杨徐邱犯故意杀人罪，判处死刑，剥夺政治权利终身；犯强奸罪，判处有期徒刑十年，决定执行死刑，剥夺政治权利终身。
杨徐邱不服判决、提起上诉。杨徐邱当时的辩护人周平指出，认定杨徐邱犯故意杀人罪“缺乏直接证据、缺乏科学依据”；指控其强奸金某某，则是在双方邻里纠纷打架斗殴时告发的，仅是“怀疑有此事或者通奸”。
同年6月10日，云南省高院做出二审判决。该院审理认为，原审法院认定事实清楚，定罪准确，审判程序合法，但鉴于本案具体情况，原判量刑偏重。据此，依法判决撤销大理州中院的一审判决，杨徐邱犯故意杀人罪、强奸罪，决定执行死刑，缓期二年执行。
值得注意的是，在该判决书中，只是笼统地提到“鉴于本案具体情况”，未予以详细说明。被改判死缓后，杨徐邱仍然不服判决，提出申诉。
1998年11月11日，云南省高院驳回了杨徐邱的申诉。杨徐邱又以“证明案件事实的主要证据之间存在矛盾”“不具备作案时间”等为由，向最高人民法院申诉。
